Чтобы запустить на отладку в Zend Studio php скрипт, без использования плагина для браузера Zend Studio Toolbar надо в браузере запустить отлаживаемый скрипт со следующими параметрами:

http://example.com/script.php?start_debug=1&debug_host=127.0.0.1&no_remote=1&debug_port=10137&debug_stop=1

Конечно в самом браузере так отладку запускать неудобно, проще установить плагин и не мучаться. А вот при отладке скриптов запускаемых с помощью например cURL это очень поможет.